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經(jīng)典案例
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)揭示人鼠早期胚胎發(fā)育基因程序
研究背景
哺乳動(dòng)物早期胚胎發(fā)育是一個(gè)復(fù)雜的過程涉及到轉(zhuǎn)錄層面架構(gòu)的巨大變化。在此，我們使用單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)對(duì)人和鼠從卵母細(xì)胞桑葚胚期到進(jìn)行了深入的轉(zhuǎn)錄組動(dòng)態(tài)變化分析。
研究方法
研究結(jié)果
1 a：無監(jiān)督層次聚類圖；b：不同階段基因表達(dá)量主成分分析；c：?jiǎn)渭?xì)胞胚胎與桑椹胚的相關(guān)性分析；d：?jiǎn)渭?xì)胞期激活79個(gè)基因在各個(gè)時(shí)期的表達(dá)量聚類熱圖。
2 a：WGCNA分析各模塊層次聚類圖；b：熱圖展示7313個(gè)基因在7個(gè)階段的表達(dá)量熱圖。
3 a：不同數(shù)據(jù)獲得的各個(gè)階段保守得分熱圖；b：人與鼠各模塊間的相關(guān)性。
研究結(jié)論
本研究說明，單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可有效提高人胚胎細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組定量水平。研究極大的擴(kuò)展了我們對(duì)人類早期胚胎轉(zhuǎn)錄組架構(gòu)、基因激活順序、遺傳編程的認(rèn)識(shí)。多物種研究揭示了人早期胚胎發(fā)育的轉(zhuǎn)錄機(jī)制是高度保守的，是一種進(jìn)化上的保守分子過程，包括一些關(guān)鍵基因的驅(qū)動(dòng)。通過共表達(dá)模塊分析也看到了人跟鼠的一些不同。
參考文獻(xiàn)
Genetic programs in human and mouse early embryos revealed by single-cell RNA sequencing. [Nature, 2013]
