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轉(zhuǎn)錄調(diào)控測序
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lncRNA測序
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常見問題
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常見問題
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
1、lncRNA測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?
答:lncRNA測序具有以下優(yōu)勢:(1)可以直接測定每個轉(zhuǎn)錄本片段序列、單核苷酸分辨率的準(zhǔn)確度,同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測細(xì)胞中少至幾個拷貝的稀有轉(zhuǎn)錄本;(3)可以對任意物種進(jìn)行分析,無需預(yù)先設(shè)計(jì)特異性探針,因此無需了解物種基因信息,能夠直接對任何物種進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,能夠檢測mRNA與lncRNA,可以發(fā)現(xiàn)新的lncRNA分子,并準(zhǔn)確地識別可變剪切位點(diǎn)及cSNP,UTR區(qū)域;(4)檢測范圍廣,高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
2、lncRNA測序能得到哪些結(jié)果?答:ncRNA測序是用于mRNA與lncRNA表達(dá)量定量的技術(shù),可以得到樣本中所有基因、lncRNA的表達(dá)量。與芯片相比,除了定量之外,還能對轉(zhuǎn)錄本可變剪切,突變位點(diǎn),融合基因,是否是新lncRNA進(jìn)行分析。
3、貴公司的分析除了標(biāo)準(zhǔn)分析,后續(xù)可以個性化分析?答:生因生物首先會給客戶一個標(biāo)準(zhǔn)分析,標(biāo)準(zhǔn)分析涵蓋了絕大部分研究所需要的數(shù)據(jù),通??梢詽M足需求。同時可提供數(shù)據(jù)非常規(guī)分析,可針對各個項(xiàng)目,各個實(shí)驗(yàn)需求進(jìn)行個性化分析。
4、實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)有什么要求嗎,需要做生物學(xué)重復(fù)嗎?答:lncRNA測序同其它實(shí)驗(yàn)一樣,為了消除個體差異,實(shí)驗(yàn)操作差異等影響,得到更為科學(xué)的可重復(fù)的結(jié)果,建議每組做三個以上的重復(fù)。
5、準(zhǔn)備樣品時,有什么注意事項(xiàng)呢?答:收樣品時注意兩點(diǎn),第一,保證能夠提供足量的Total RNA,轉(zhuǎn)錄組測序要求 細(xì)胞 ≥5×106個,組織 ≥40mg,Total RNA ≥5ug;第二,保證RNA的完整性,RNA降解無法進(jìn)行建庫測序,應(yīng)注意收集樣品的規(guī)范操作。
6、項(xiàng)目周期是多久?答:樣品合格情況下,為35天。
