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宏基因組測序
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
技術(shù)簡介
宏基因組測序是以環(huán)境中全部微生物為研究對(duì)象，通過提取環(huán)境中整個(gè)微生物群落的總DNA，利用高通量測序測序技術(shù)進(jìn)行大規(guī)模測序，通過生物信息學(xué)分析，研究微生物與環(huán)境、與宿主相互之間的關(guān)系，它擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制。高通量測序平臺(tái)具有通量高、準(zhǔn)確性高、速度快、信息全等特點(diǎn)，能夠顯著加快宏基因組學(xué)研究的進(jìn)程，并且在鑒定低豐度的微生物群落及種類，挖掘更多基因資源方面具有非常大的優(yōu)勢。該技術(shù)常用來研究環(huán)境微生物的群落結(jié)構(gòu)、物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等，已廣泛應(yīng)用于微生物基因組研究。
技術(shù)優(yōu)勢
1、無需對(duì)微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)，直接提取微生物群落總DNA；
2、可同時(shí)鑒定幾乎所有的微生物種類；
3、信息分析全面，除了對(duì)物種信息挖掘，還能得到群落表達(dá)的重要基因信息等；
4、可快速，高效，大樣本的對(duì)群落進(jìn)行分析。
樣本要求
樣品濃度 DNA≥50ng/μl；樣品總量 DNA≥10μg
實(shí)驗(yàn)周期
50天
生因生物分析團(tuán)隊(duì)已完成上千個(gè)項(xiàng)目的個(gè)性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Illumina Hiseq 2500、Illumina Hiseq 4000等測序平臺(tái)，可為研究者提供多樣化的測序服務(wù)和個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級(jí)期刊，平均影響因子達(dá)到6。
