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相關(guān)文獻(xiàn)
轉(zhuǎn)錄調(diào)控測(cè)序
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問(wèn)題
技術(shù)簡(jiǎn)介
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是指將特定狀態(tài)下的特定組織或細(xì)胞的所有mRNA提取，并進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序，得到所有mRNA表達(dá)信息的一種技術(shù)手段。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能夠動(dòng)態(tài)反映基因的轉(zhuǎn)錄情況，與常規(guī)基因芯片不同的是，轉(zhuǎn)錄組除了能得到基因的表達(dá)量外，還能夠得到轉(zhuǎn)錄本的可變剪切，融合基因，位點(diǎn)突變，同時(shí)能夠發(fā)現(xiàn)未報(bào)道的新轉(zhuǎn)錄本。目前，該技術(shù)已經(jīng)成為高通量獲得基因表達(dá)情況的主要手段。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序打破了物種限制，無(wú)需提前得到基因組信息，也無(wú)需設(shè)計(jì)探針，可獲得任何物種的轉(zhuǎn)錄本信息。真核有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，是將獲得的序列直接比對(duì)到參考基因組上，進(jìn)而進(jìn)行后續(xù)分析。
數(shù)據(jù)分析
基因表達(dá)水平分析
差異基因表達(dá)分析 差異基因GO/KEGG分析 蛋白網(wǎng)絡(luò)分析 基因共表達(dá)分析
基因結(jié)構(gòu)水平分析
可變剪切分析 融合基因分析 Snp/InDel分析 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)
樣本要求
細(xì)胞 ≥5×106個(gè)； 組織 ≥40mg； Total RNA ≥5ug
實(shí)驗(yàn)周期
30天
生因生物分析團(tuán)隊(duì)已完成上千個(gè)項(xiàng)目的個(gè)性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測(cè)序平臺(tái)，可為研究者提供多樣化的測(cè)序和個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級(jí)期刊，平均影響因子達(dá)到6。
