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真核有參轉(zhuǎn)錄組測序
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
技術(shù)簡介
轉(zhuǎn)錄組測序是指將特定狀態(tài)下的特定組織或細胞的所有mRNA提取，并進行建庫測序，得到所有mRNA表達信息的一種技術(shù)手段。轉(zhuǎn)錄組測序能夠動態(tài)反映基因的轉(zhuǎn)錄情況，與常規(guī)基因芯片不同的是，轉(zhuǎn)錄組除了能得到基因的表達量外，還能夠得到轉(zhuǎn)錄本的可變剪切，融合基因，位點突變，同時能夠發(fā)現(xiàn)未報道的新轉(zhuǎn)錄本。目前，該技術(shù)已經(jīng)成為高通量獲得基因表達情況的主要手段。轉(zhuǎn)錄組測序打破了物種限制，無需提前得到基因組信息，也無需設(shè)計探針，可獲得任何物種的轉(zhuǎn)錄本信息。真核有參轉(zhuǎn)錄組測序，是將獲得的序列直接比對到參考基因組上，進而進行后續(xù)分析。
數(shù)據(jù)分析
基因表達水平分析
差異基因表達分析 差異基因GO/KEGG分析 蛋白網(wǎng)絡(luò)分析 基因共表達分析
基因結(jié)構(gòu)水平分析
可變剪切分析 融合基因分析 Snp/InDel分析 新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測
樣本要求
細胞 ≥5×106個； 組織 ≥40mg； Total RNA ≥5ug
實驗周期
30天
生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺，可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級期刊，平均影響因子達到6。
