smallRNA測(cè)序
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問(wèn)題
技術(shù)簡(jiǎn)介

small RNA是一類長(zhǎng)度在18~30nt的RNA分子,包括miRNA、siRNA、snRNA、piRNA、rRNA、tRNA等,在基因表達(dá)調(diào)控、生物個(gè)體發(fā)育、代謝及疾病的發(fā)生等生理過(guò)程中起著重要的作用。small RNA測(cè)序是基于二代測(cè)序技術(shù),能夠?qū)悠分衧mall RNA進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序,可獲得上千萬(wàn)條small RNA序列。通過(guò)生物信息學(xué)分析,可以得到已知small RNA與未知small RNA的種類和表達(dá)量。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1、高精度:靈敏度高,測(cè)序通量大,為smallRNA分子的發(fā)現(xiàn)和研究提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率,能夠檢測(cè)豐度極低的稀有轉(zhuǎn)錄;
2、可發(fā)現(xiàn)新的miRNA分子:擺脫芯片依賴已知miRNA的局限,可以鑒定新的miRNA;
3、無(wú)物種限制:可以對(duì)任意物種進(jìn)行高通量分析,無(wú)需任何預(yù)先的序列信息以及二級(jí)結(jié)構(gòu)信息;
4、檢測(cè)范圍廣:高于6個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍,能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
樣本要求

細(xì)胞 ≥5×106個(gè);組織 ≥40mg;Total RNA ≥5ug
實(shí)驗(yàn)周期

30天
生因生物分析團(tuán)隊(duì)已完成上千個(gè)項(xiàng)目的個(gè)性化數(shù)據(jù)分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測(cè)序平臺(tái),可為研究者提供多樣化的測(cè)序和個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級(jí)期刊,平均影響因子達(dá)到6。
