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技術(shù)介紹
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問題
技術(shù)簡介
長鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一類長度大于200nt的非編碼RNA分子。近幾年研究發(fā)現(xiàn)lncRNA能夠與蛋白質(zhì)、DNA、RNA等相互作用，參與多種生物學(xué)過程的調(diào)控，在腫瘤、疾病發(fā)生及機體發(fā)育過程中扮演著重要作用。
長鏈非編碼RNA測序（LncRNA Sequencing）是通過去除rRNA,構(gòu)建鏈特異性文庫，對mRNA及l(fā)ncRNA進行高通量測序的一種技術(shù)，能夠分析不同實驗條件下mRNA及l(fā)ncRNA的即時表達情況。該技術(shù)可以精確到單個核苷酸的分辨率，同時鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本，獲得轉(zhuǎn)錄本的可變剪切，位點突變等信息，已成為lncRNA高通量鑒定和定量的主要手段。
數(shù)據(jù)分析
mRNA表達水平分析
基因差異表達分析 差異表達基因GO/KEGG分析 蛋白網(wǎng)絡(luò)分析 基因共表達分析
lncRNA表達水平分析
lncRNA差異表達分析 novel lncRNA鑒定 cis作用靶基因預(yù)測 trans作用靶基因預(yù)測 lncRNA序列保守性分析
基因結(jié)構(gòu)水平分析
可變剪切分析 融合基因分析 Snp/InDel分析
技術(shù)路線：
樣本要求
細胞 ≥5×106個；組織 ≥40mg；Total RNA ≥5ug
實驗周期
35天
生因生物分析團隊已完成上千個項目的個性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺，可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級期刊，平均影響因子達到6。
