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circRNA測序

技術介紹       數(shù)據(jù)分析       經(jīng)典案例       常見問題




1、circRNA測序比其他研究方法有哪些優(yōu)勢?

答:circRNA測序具有以下優(yōu)勢:(1)可以直接測定每個circRNA序列、單核苷酸分辨率的準確度,同時不存在傳統(tǒng)微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題;(2)靈敏度高,可以檢測細胞中少至幾個拷貝的稀有circRNA;(3)可以對任意有參物種進行circRNA分析,無需預先設計特異性探針,同時能夠檢測未知circRNA;(4)檢測范圍廣,高于6個數(shù)量級的動態(tài)檢測范圍,能夠同時鑒定和定量稀有circRNA和正常circRNA。


2、circRNA測序能得到哪些結果?

答:circRNA測序能得夠鑒定出所有樣品中含有的circRNA(包括已知circRNA和未知circRNA),并進行差異表達分析,同時提供所有鑒定出的circRNA序列便于后續(xù)研究。


3、貴公司的分析除了標準分析,后續(xù)可以個性化分析?

答:生因生物首先會給客戶一個標準分析,標準分析涵蓋了絕大部分研究所需要的數(shù)據(jù),通??梢詽M足需求。同時可提供數(shù)據(jù)非常規(guī)分析,可針對各個項目,各個實驗需求進行個性化分析。此外,由于circRNA的鑒定的不同算法結果差異很大,為保證分析結果的可靠性,生因生物采用多種算法同時鑒定、定量circRNA。


4、實驗設計有什么要求嗎,需要做生物學重復嗎?
答:circRNA測序同其它實驗一樣,為了消除個體差異,實驗操作差異等影響,得到更為科學的可重復的結果,建議每組做三個以上的重復。


5、準備樣品時,有什么注意事項呢?

答:收樣品時注意兩點,第一,保證能夠提供足量的Total RNA,circRNA測序要求 細胞 ≥1×107個,組織 ≥50mg,Total RNA ≥10ug;第二,保證RNA的完整性,RNA降解無法進行建庫測序,應注意收集樣品的規(guī)范操作。


6、項目周期是多久?
答:樣品合格情況下,為35天。


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