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技術(shù)介紹

技術(shù)介紹       數(shù)據(jù)分析       經(jīng)典案例       常見問題




技術(shù)簡介


       環(huán)狀RNA(circRNA)是一類環(huán)狀的非編碼RNA,廣泛存在于各類生物中。由于環(huán)狀RNA能夠發(fā)揮競爭性內(nèi)源RNA作用,順式調(diào)控基因的表達(dá),同時,環(huán)狀RNA有較強的組織表達(dá)特異性,不易降解,具有biomarker的潛力,逐漸成為研究熱點。環(huán)狀RNA測序(CircRNA Sequencing)能夠?qū)悠分械乃衏ircRNA建庫、測序獲得所有已知與未知的circRNA分子,已成為circRNA表達(dá)高通量研究的主要手段。


       生因生物circRNA測序采用Illumina Hiseq 4000平臺進(jìn)行測序,針對各類樣本開展準(zhǔn)確的circRNA鑒定,表達(dá)分析。已有多篇文獻(xiàn)發(fā)表于各類頂級期刊。



數(shù)據(jù)分析



            circRNA分析

            circRNA鑒定(多種算法)    差異circRNA表達(dá)分析    來源基因GO/PATHWAY分析    microRNA結(jié)合位點預(yù)測




樣本要求




細(xì)胞 ≥1×107個;組織 ≥50mg;Total RNA ≥10ug;



實驗周期



35天



       生因生物分析團(tuán)隊已完成上千個項目的個性化數(shù)據(jù)分析,依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測序平臺,可為研究者提供多樣化的測序和個性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級期刊,平均影響因子達(dá)到6。


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