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相關(guān)文獻(xiàn)
經(jīng)典案例
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見問(wèn)題
深入分析膀胱癌中差異表達(dá)lncRNAs和circRNA的共同表達(dá)和ceRNA網(wǎng)絡(luò)
研究背景
膀胱癌是最常見的泌尿系統(tǒng)癌癥，在不同的國(guó)家均具有較高的發(fā)病率和死亡率。目前膀胱癌已經(jīng)是第七男性最常見的癌癥。根據(jù)全球癌癥統(tǒng)計(jì)每年約新增440,000名確診的膀胱癌患者，并且有130,000名患者死于膀胱癌。膀胱癌在中國(guó)的發(fā)病率和死亡率在過(guò)去的幾十年逐年上升，已經(jīng)成為發(fā)病率最高的泌尿系統(tǒng)癌癥和死亡率僅次于直腸癌的惡性癌癥。人的基因組中大約有5%-10%的序列會(huì)被轉(zhuǎn)錄，其中約有10-20%是編碼蛋白的RNA，其余80-90%是不編碼蛋白的RNA。近年來(lái)越來(lái)越多的研究表明非編碼轉(zhuǎn)錄本在癌癥的發(fā)病和發(fā)育過(guò)程中起著非常重要的作用。
研究方法
對(duì)膀胱癌與癌旁的lncRNA、circRNA和mRNA進(jìn)行高通量分析。
研究結(jié)果
1 A,B,C分別是lncRNAs,circRNAs,mRNAs的表達(dá)量聚類熱圖。
2 A：mRNA GO富集分析；B：mRNA PATHWAY富集分析；C：通路網(wǎng)絡(luò)圖。
3 A：上調(diào)circRNA來(lái)源基因的GO富集分析；B：下調(diào)circRNA來(lái)源基因的GO富集分析。
4 mRNA與lncRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析。
5）ceRNA網(wǎng)絡(luò)分析。
研究結(jié)論
本研究發(fā)現(xiàn)了幾種與膀胱癌發(fā)生發(fā)展相關(guān)的lncRNAs和circRNAs，可能成為臨床診斷分子標(biāo)志物。同時(shí)，有些lncRNAs、circRNAs分子可能用于膀胱癌的診斷和治療，具有重要的生物學(xué)意義。
參考文獻(xiàn)
Comprehensive analysis of differentially expressed profiles of lncRNAs and circRNAs with associated co-expression and ceRNA networks in bladder carcinoma. [Oncotarget, 2016]
