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相關(guān)文獻(xiàn)
RIP-seq
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見(jiàn)問(wèn)題
技術(shù)簡(jiǎn)介
RIP-seq是將RNA免疫共沉淀獲得RNA采用高通量測(cè)序技術(shù)得到與蛋白質(zhì)結(jié)合的所有RNA的序列信息，通過(guò)后續(xù)的數(shù)據(jù)分析可以獲得與蛋白質(zhì)相互作用的基因、RNA信息。是研究轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動(dòng)態(tài)過(guò)程、尋找miRNA的作用靶點(diǎn)等的有效手段。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1、轉(zhuǎn)錄組覆蓋廣：與芯片相比，可在全轉(zhuǎn)錄組范圍對(duì)蛋白結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行篩選與鑒定；
2、高靈敏度：每個(gè)樣本可獲得數(shù)百萬(wàn)條的序列，可發(fā)現(xiàn)研究轉(zhuǎn)錄組上稀有的蛋白結(jié)合位點(diǎn)；
3、高精確率：可精確定位RNA與蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)；
4、定量范圍廣：高于6個(gè)數(shù)量級(jí)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍，能夠同時(shí)鑒定和定量稀有轉(zhuǎn)錄本和正常轉(zhuǎn)錄本。
樣本要求
RNA樣品量大于10ng；濃度大于50ng/ul
實(shí)驗(yàn)周期
40天
生因生物分析團(tuán)隊(duì)已完成上千個(gè)項(xiàng)目的個(gè)性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Hiseq 4000、Hiseq Xten、PacBio RS II等測(cè)序平臺(tái)，可為研究者提供多樣化的測(cè)序和個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級(jí)期刊，平均影響因子達(dá)到6。
