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相關(guān)文獻(xiàn)
技術(shù)介紹
技術(shù)介紹 數(shù)據(jù)分析 經(jīng)典案例 常見(jiàn)問(wèn)題
技術(shù)簡(jiǎn)介
宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是以環(huán)境中全部微生物為研究對(duì)象，通過(guò)提取環(huán)境中整個(gè)微生物群落的總RNA，利用高通量測(cè)序測(cè)序技術(shù)進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序，通過(guò)生物信息學(xué)分析，研究微生物與環(huán)境、與宿主相互之間的關(guān)系，它擺脫了傳統(tǒng)研究中微生物分離培養(yǎng)的技術(shù)限制。高通量測(cè)序平臺(tái)具有通量高、準(zhǔn)確性高、速度快、信息全等特點(diǎn)，能夠顯著加快微生物轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的進(jìn)程，并且在鑒定低豐度的微生物群落及種類(lèi)，挖掘更多基因資源方面具有非常大的優(yōu)勢(shì)。該技術(shù)常用來(lái)研究環(huán)境微生物的微生物-宿主互作、基因功能及代謝網(wǎng)絡(luò)等，已廣泛應(yīng)用于微生物研究。相較于宏基因組，宏轉(zhuǎn)錄組能從轉(zhuǎn)錄水平研究復(fù)雜微生物群落變化，能更好的挖掘潛在的新基因、差異表達(dá)的基因及其功能以及代謝通路的構(gòu)建。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
1、無(wú)需對(duì)微生物進(jìn)行分離培養(yǎng)，直接提取微生物群落總RNA；
2、可同時(shí)鑒定幾乎所有的微生物種類(lèi)；
3、信息分析全面，除了對(duì)物種信息挖掘，還能得到重要基因的表達(dá)豐度，差異變化等進(jìn)行分析；
4、可快速，高效，大樣本的對(duì)多個(gè)群落進(jìn)行分析。
樣本要求
樣品濃度 RNA ≥50ng/μl；樣品總量 RNA ≥10μg
實(shí)驗(yàn)周期
50天
生因生物分析團(tuán)隊(duì)已完成上千個(gè)項(xiàng)目的個(gè)性化數(shù)據(jù)分析，依托Illumina Hiseq 2000、Illumina Hiseq 2500、Illumina Hiseq 4000等測(cè)序平臺(tái)，可為研究者提供多樣化的測(cè)序服務(wù)和個(gè)性化的數(shù)據(jù)分析服務(wù)。多篇文獻(xiàn)發(fā)表在Nature、Science、Cell等頂級(jí)期刊，平均影響因子達(dá)到6。
